Logo nl.boatexistence.com

Hoe wordt metagenomics gedaan?

Inhoudsopgave:

Hoe wordt metagenomics gedaan?
Hoe wordt metagenomics gedaan?

Video: Hoe wordt metagenomics gedaan?

Video: Hoe wordt metagenomics gedaan?
Video: Metagenomics principles and workflow 2024, Mei
Anonim

Metagenomics wordt gedefinieerd als de directe genetische analyse van genomen in een omgevingsmonster Het veld begon aanvankelijk met het klonen van omgevings-DNA, gevolgd door screening op functionele expressie [1], en werd vervolgens snel aangevuld met directe willekeurige shotgun-sequencing van omgevings-DNA [2, 3].

Wat is het proces van metagenomics?

Metagenomics omvat het verkrijgen van DNA van alle micro-organismen binnen een gemeenschap, zonder noodzakelijkerwijs alle betrokken soorten te identificeren. Nadat de genen zijn gesequenced en vergeleken met geïdentificeerde sequenties, kunnen de functies van deze genen worden bepaald.

Welke techniek wordt gebruikt in metagenomics?

Een monster van de microbiële gemeenschap wordt verzameld uit zeewater, sediment, gastdier of andere mariene habitat. De verzamelde cellen worden vervolgens gelyseerd en DNA wordt uit hun lysaat geëxtraheerd. De techniek die metagenomics mogelijk maakt, is shotgun-sequencing, waarbij willekeurige DNA-gebieden op een ongerichte manier worden gesequenced.

Wat zijn de 3 stappen om metagenomics te bestuderen?

Stappen en proces van metagenomics:

  1. Voorbeeldverzameling:
  2. DNA-extractie:
  3. Monstervoorbereiding:
  4. Voorbeeldanalyse:

Hoe wordt functionele metagenomica uitgevoerd?

Functionele metagenomica omvat het isoleren van DNA van microbiële gemeenschappen om de functies van gecodeerde eiwitten te bestuderen. Het omvat het klonen van DNA-fragmenten, het tot expressie brengen van genen in een surrogaatgastheer en het screenen op enzymatische activiteiten.

Aanbevolen: