BigWig is een bestandsformaat voor weergave van dichte, continue gegevens in een genoombrowsertrack, gecreëerd door conversie van Wiggle (WIG)-formaat. De BigWig-indeling wordt beschreven op de UCSC Genome Bioinformatics-website en de Broad Institute-gids voor bestandsindelingen biedt aanvullende informatie.
Wat is het bigWig-formaat?
Het bigWig-formaat is voor weergave van dichte, continue gegevens die worden weergegeven als een grafiek BigWig-bestanden worden aanvankelijk gemaakt van bestanden van het WIG-type, met behulp van het UCSC-programma wigToBigWig. Als alternatief kunnen bigWig-bestanden worden gemaakt van bedGraph-bestanden, met behulp van het UCSC-programma bedGraphToBigWig.
Hoe gebruik ik een bigWig-bestand?
Verplaats het nieuw gemaakte bigWig-bestand (myBigWig.bw) naar een voor het web toegankelijke http-, https of ftp-locatie. Plak de URL in het invoerformulier voor aangepaste tracks of maak een aangepaste track met behulp van een enkele tracklijn. Plak de aangepaste spoorlijn in het tekstvak op de aangepaste spoorbeheerpagina.
Wat is een bigWig-nummer?
bigWig Tracks zijn tracks voor continue signalen over het hele genoom. Ze zijn geschikt voor het weergeven van verschillende "onbewerkte" experimentresultaten zoals ChIP-Seq-signalen, RNA-Seq-signalen, enz.
Hoe maak ik een bigWig-bestand aan?
Er zijn meerdere manieren om grote bestanden te genereren. Meestal gaat het om het converteren van een. bam-bestand naar een wiebelspoor (.pruik) en converteer het wiebelspoor vervolgens naar een binair hoofdbestanddeel (.
