SDS bindt sterk aan de positief geladen en de hydrofobe resten van eiwitten via zijn sulfaatgroepen en alkylketens , respectievelijk13 Dienovereenkomstig, het is een waardevol detergens op het gebied van structurele biologie en eiwitvouw-/ontvouwingsstudies.
Wat doet SDS met een eiwit?
SDS is een amfipathische oppervlakteactieve stof. Het denatureert eiwitten door zich met zijn koolwaterstofstaart aan de eiwitketen te binden, waardoor normaal begraven gebieden worden blootgelegd en de eiwitketen wordt bedekt met oppervlakteactieve moleculen. De polaire kopgroep van SDS voegt een extra voordeel toe aan het gebruik van dit denatureringsmiddel.
Hoe bindt SDS aan aminozuren?
De SDS heeft een hydrofobe staart die sterk interageert met eiwitketens (polypeptideketens). Het aantal SDS-moleculen dat aan een eiwit bindt, is proportioneel aan het aantal aminozuren waaruit het eiwit bestaat. Elk SDS-molecuul draagt twee negatieve ladingen bij, waardoor elke lading die het eiwit kan hebben, overweldigt.
Omhult SDS eiwitten?
SDS omhult het eiwit ook met een uniforme negatieve lading, die de intrinsieke ladingen op de R-groepen maskeert. SDS bindt vrij uniform aan de lineaire eiwitten (ongeveer 1,4 g SDS/1 g eiwit), wat betekent dat de lading van het eiwit nu ongeveer evenredig is met zijn molecuulgewicht.
Hoe geeft SDS eiwit een negatieve lading?
SDS is een wasmiddel dat een lange alifatische keten en een sulfaatgroep bevat. Dit detergens interageert met gedenatureerde eiwitten om een sterk negatief geladen complex te vormen (de negatieve lading die voortkomt uit de SO42 − groepen SDS). De eiwitten worden eerst door warmte gedenatureerd en vervolgens wordt het SDS in grote overmaat toegevoegd.
